az118 (az118) wrote,
az118
az118

дерево субвкладов Y-гаплотипа R1a

Проект R1a.org


Проект FamilyTreeDNA.com


Форум forum.molgen.org 

описание древних родов  
и связь с археологическими культурами 

Проект GENTIS 


пример

имеются 3 сиквенса

v1: AGG-ATT-TAT-GTA
v2: AGA-ATC-TAT-GTA
v3: AGA-ATT-TAC-GCA

Вариабельные позиции выделены цветом; мы будем обозначать их цифрами 1, 2, 3 и 4. В каждой из них чередуются нуклеотиды двух типов, причем все различия являются транзициями. Как мы уже упоминали в предыдущем разделе, трансверсии встречаются значительно реже транзиций, а чередования более чем двух нуклеотидов в одной позиции - исключительная редкость. Разумно предположить, что общий предок трех данных сиквенсов в каждой позиции имел нуклеотид, встречающийся у большинства потомков:

v0: AGA-ATT-TAT-GTA

но при этом любой из трех сиквенсов v1, v2 и v3 хотя бы в одной позиции отличается от своего предка. Иными словами, где-то на эволюционном пути от сиквенса v0 к трем его потомков произошли мутации, а именно, линии v1 и v2 мутировали в одной позиции, а v3 - сразу в двух. В каком порядке происходили мутации в линии v3? Ответить на данный вопрос, имея в наличии только указанный элайнмент, невозможно, например сначала могла произойти мутация в 3-ей вариабельной позиции, а затем в 4-ой, либо наоборот, сначала в 4-ой а затем в 3-ей, или наконец, обе мутации могли произойти одновременно при одной трансмиссии, хотя это и маловероятно. Однако, если бы в нашем элайнменте присутствовал такой сиквенс:

v4: AGA-ATT-TAT-GCA

то обнаружим, что он лежит "на полпути" между вариантом v3 и общим предком v0, имея только одну мутировавшую позицию - 4-ую. Таким образом, сиквенс v4 - предок сиквенса v3, что не мешает обоим "жить" в одно время, ведь мы сейчас рассматриваем не реальные организмы, а участки их ДНК, которые могут мутировать с разной скоростью, вследствие чего среди живых потомков v4 есть как неизменные, так и мутировавшие до состояния v3. Более того, среди ныне живущих организмов вполне может встретиться и носитель предкового типа v0, хотя со временем количество таких неизмененных вариантов убывает.

v0 ─┬─ v1
    │
    ├─ v2
    │
    └─ v4 ─ v3

________________________________________

Наследование Y и мт-гаплотипов

       отец-1   мать-1                     отец-2    мать-2
       Xp1-Y1 Xmm1-Xmp1                    Xp2-Y2  Xmm2-Xmp2

сын-11  cын-12  дочь-11  дочь-12    сын-21  сын-22  дочь-21  дочь-22
Xmm1-Y1 Xmp1-Y1 Xp1-Xmm1 Xp1-Xmp1   Xmm2-Y2 Xmp2-Y2 Xp2-Xmm2 Xp2-Xmp2

     внук-11-21-1  внук-11-21-2  внучка-11-21-1  внучка-11-21-2
        Xp2-Y1       Xmm2-Y1        Xmm1-Xp2        Xmm1-Xmm2

     внук-21-11-1  внук-22-12-1  внучка-22-12-1  внучка-22-12-2
        Xp1-Y2       Xp1-Y2         Xmp2-Xp1        Xmp2-Xmp1
Tags: r1a, археология, генетика
Subscribe

  • кошачья топология

    я гладил Кошку за ушами и целовал ее глаза рука спустилась к двум холмам с торчащими в зенит вершками потом скользнула по долине к ущелью между двух…

  • сто тысяч лет тому назад

    сто тысяч лет тому назад я посадил свой зоосад в нем были звери и вода деревья небо провода на них висели колдуны играя бликами луны колдуньи…

  • фантамасгория

    вот Пенелопе Круз пришел однажды груз завернутый в кумач издохший старый грач она его тайком полила кипятком раздался громкий хруст и вылез Марсель…

  • Post a new comment

    Error

    Anonymous comments are disabled in this journal

    default userpic

    Your reply will be screened

    Your IP address will be recorded 

  • 0 comments